با تأسی از سیره انبیای الهی و ائمه معصومین (ع) به انگیزه تجلی مبانی والای انسان دوستی، اشتیاق بیکران و خلوص و اعتقاد انسانهای مؤمن به ایجاد امکانات و زمینه‌های آموزشی و تربیتی به منظور رشد و شکوفایی استعدادهای جوانان ایران اسلامی و همچنین بهره‌گیری از توانمندی‌های مادی و معنوی خیرین و تشویق و ترغیب توانگران و نیک‌اندیشان در تقویت و گسترش زیرساخت‌های آموزش عالی، بارقه‌ای گردید تا افراد خیّر و خداجوی با عزمی راسخ و اراده‌ای مشترک، سازمانی مردم نهاد (NGO) به نام بنیاد خیرین حامی دانشگاه اردکان تأسیس نمایند.

این بنیاد در تاریخ ۱۳۹۸/۰۴/۰۴ به شماره ثبت ۵۵ به شناسه ملی ۱۴۰۰۷۶۷۴۲۹۰ با موضوع امور خیریه مرتبط با فقرزدایی زیرساختی، ساخت و تجهیز دانشگاه به طور رسمی ثبت گردیده است.